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mRNA上3个相邻的碱基决定1个氨基酸。每3个这样的碱基叫做1个密码子。
密码子优化是通过基因工程技术，根据宿主的密码子偏好性调整基因的同义密码子，达到消除稀有密码子的目的，并且优化如mRNA二级结构和Motif等相关参数，从而提高翻译效率。当异源基因在宿主中无法有效表达时，可以考虑进行密码子优化，调整同义密码子和相关的调控元件，提高翻译效率。通过这种方法提高异源基因翻译效率的报道已经很多。如为了在人胚胎肾细胞（HEK293T）中提高重组猪白细胞介素-7（pIL-7）的表达，崔丹等依据人密码子的偏好对pIL-7基因进行了优化修饰，结果显示，密码子优化后pIL-7基因在HEK293T细胞中的表比野生型pIL-7基因的表达水平提高了2倍多，可见密码子优化可明显提高重组pIL-7在HEK293T细胞中的表达[1]。
密码子优化型IL-7基因表达水平与其野生型基因的比较[1]
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